Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Upk1aQ9D132 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upk1aQ9D132 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upk1aQ9D132 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upk1aQ9D132 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upk1aQ9D132 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upk1aQ9D132 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Upk1aQ9D132 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upk1aQ9D132 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Upk1aQ9D132 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Upk1aQ9D132 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Upk1aQ9D132 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Upk1aQ9D132 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Upk1aQ9D132 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms