Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Twist2Q9D030 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Twist2Q9D030 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Twist2Q9D030 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Twist2Q9D030 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Twist2Q9D030 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Twist2Q9D030 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Twist2Q9D030 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Twist2Q9D030 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Twist2Q9D030 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Twist2Q9D030 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Twist2Q9D030 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Twist2Q9D030 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Twist2Q9D030 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Twist2Q9D030 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Twist2Q9D030 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Twist2Q9D030 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms