Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl55Q9CZ83 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl55Q9CZ83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl55Q9CZ83 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl55Q9CZ83 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl55Q9CZ83 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl55Q9CZ83 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms