Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17509Q9CZ61 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17509Q9CZ61 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm17509Q9CZ61 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm17509Q9CZ61 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm17509Q9CZ61 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm17509Q9CZ61 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17509Q9CZ61 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm17509Q9CZ61 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm17509Q9CZ61 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17509Q9CZ61 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17509Q9CZ61 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17509Q9CZ61 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17509Q9CZ61 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17509Q9CZ61 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17509Q9CZ61 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17509Q9CZ61 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17509Q9CZ61 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17509Q9CZ61 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17509Q9CZ61 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17509Q9CZ61 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms