Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9CYI0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9CYI0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q9CYI0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q9CYI0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Q9CYI0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q9CYI0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q9CYI0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9CYI0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9CYI0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q9CYI0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9CYI0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Q9CYI0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q9CYI0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Q9CYI0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q9CYI0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9CYI0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9CYI0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q9CYI0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q9CYI0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q9CYI0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9CYI0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Q9CYI0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9CYI0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q9CYI0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q9CYI0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q9CYI0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q9CYI0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q9CYI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q9CYI0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q9CYI0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q9CYI0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Q9CYI0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q9CYI0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q9CYI0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q9CYI0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q9CYI0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q9CYI0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9CYI0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Q9CYI0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9CYI0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q9CYI0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9CYI0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms