Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim13Q9CYB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim13Q9CYB0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim13Q9CYB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim13Q9CYB0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim13Q9CYB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim13Q9CYB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim13Q9CYB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim13Q9CYB0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim13Q9CYB0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim13Q9CYB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim13Q9CYB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim13Q9CYB0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim13Q9CYB0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim13Q9CYB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.5 ms