Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zcchc8Q9CYA6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zcchc8Q9CYA6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zcchc8Q9CYA6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zcchc8Q9CYA6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zcchc8Q9CYA6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zcchc8Q9CYA6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zcchc8Q9CYA6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zcchc8Q9CYA6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms