Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXJ4

Abcb8, ATP-binding cassette sub-family B member 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb8Q9CXJ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb8Q9CXJ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb8Q9CXJ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcb8Q9CXJ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcb8Q9CXJ4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcb8Q9CXJ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcb8Q9CXJ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb8Q9CXJ4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb8Q9CXJ4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb8Q9CXJ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms