Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnih4Q9CX13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnih4Q9CX13 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnih4Q9CX13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnih4Q9CX13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnih4Q9CX13 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnih4Q9CX13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnih4Q9CX13 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnih4Q9CX13 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnih4Q9CX13 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih4Q9CX13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnih4Q9CX13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnih4Q9CX13 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnih4Q9CX13 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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