Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufaf1Q9CWX2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufaf1Q9CWX2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufaf1Q9CWX2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufaf1Q9CWX2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufaf1Q9CWX2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufaf1Q9CWX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufaf1Q9CWX2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufaf1Q9CWX2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufaf1Q9CWX2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufaf1Q9CWX2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufaf1Q9CWX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ndufaf1Q9CWX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufaf1Q9CWX2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufaf1Q9CWX2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufaf1Q9CWX2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms