Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pfdn1Q9CWM4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pfdn1Q9CWM4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn1Q9CWM4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn1Q9CWM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn1Q9CWM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn1Q9CWM4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn1Q9CWM4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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