Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rprd1bQ9CSU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rprd1bQ9CSU0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rprd1bQ9CSU0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd1bQ9CSU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rprd1bQ9CSU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rprd1bQ9CSU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rprd1bQ9CSU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd1bQ9CSU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rprd1bQ9CSU0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rprd1bQ9CSU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rprd1bQ9CSU0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rprd1bQ9CSU0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd1bQ9CSU0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rprd1bQ9CSU0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd1bQ9CSU0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms