Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NmbQ9CR53 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NmbQ9CR53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NmbQ9CR53 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NmbQ9CR53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmbQ9CR53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmbQ9CR53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NmbQ9CR53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NmbQ9CR53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NmbQ9CR53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NmbQ9CR53 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NmbQ9CR53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NmbQ9CR53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NmbQ9CR53 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NmbQ9CR53 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NmbQ9CR53 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NmbQ9CR53 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms