Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR04

Hypm, Huntingtin-interacting protein M, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypmQ9CR04 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HypmQ9CR04 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HypmQ9CR04 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HypmQ9CR04 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HypmQ9CR04 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HypmQ9CR04 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HypmQ9CR04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HypmQ9CR04 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HypmQ9CR04 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HypmQ9CR04 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HypmQ9CR04 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HypmQ9CR04 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HypmQ9CR04 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HypmQ9CR04 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HypmQ9CR04 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HypmQ9CR04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HypmQ9CR04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HypmQ9CR04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HypmQ9CR04 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HypmQ9CR04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms