Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riok2Q9CQS5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riok2Q9CQS5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok2Q9CQS5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riok2Q9CQS5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riok2Q9CQS5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok2Q9CQS5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riok2Q9CQS5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riok2Q9CQS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms