Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp5f1Q9CQQ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5f1Q9CQQ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5f1Q9CQQ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5f1Q9CQQ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp5f1Q9CQQ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5f1Q9CQQ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp5f1Q9CQQ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp5f1Q9CQQ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5f1Q9CQQ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms