Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN1

Trap1, Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1Q9CQN1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trap1Q9CQN1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trap1Q9CQN1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trap1Q9CQN1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trap1Q9CQN1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trap1Q9CQN1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trap1Q9CQN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trap1Q9CQN1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trap1Q9CQN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trap1Q9CQN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trap1Q9CQN1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trap1Q9CQN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trap1Q9CQN1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trap1Q9CQN1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trap1Q9CQN1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trap1Q9CQN1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trap1Q9CQN1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trap1Q9CQN1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trap1Q9CQN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trap1Q9CQN1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trap1Q9CQN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trap1Q9CQN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trap1Q9CQN1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trap1Q9CQN1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trap1Q9CQN1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trap1Q9CQN1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trap1Q9CQN1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trap1Q9CQN1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trap1Q9CQN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trap1Q9CQN1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trap1Q9CQN1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trap1Q9CQN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trap1Q9CQN1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1Q9CQN1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trap1Q9CQN1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1Q9CQN1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trap1Q9CQN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trap1Q9CQN1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trap1Q9CQN1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms