Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mrpl20Q9CQL4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl20Q9CQL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl20Q9CQL4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl20Q9CQL4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl20Q9CQL4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl20Q9CQL4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl20Q9CQL4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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