Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr13Q9CQJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr13Q9CQJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr13Q9CQJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr13Q9CQJ5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr13Q9CQJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr13Q9CQJ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms