Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG9

Tmem100, Transmembrane protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem100Q9CQG9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem100Q9CQG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem100Q9CQG9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem100Q9CQG9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem100Q9CQG9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem100Q9CQG9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem100Q9CQG9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem100Q9CQG9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem100Q9CQG9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem100Q9CQG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem100Q9CQG9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms