Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenpmQ9CQA0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CenpmQ9CQA0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CenpmQ9CQA0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenpmQ9CQA0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpmQ9CQA0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpmQ9CQA0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpmQ9CQA0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpmQ9CQA0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpmQ9CQA0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CenpmQ9CQA0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpmQ9CQA0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpmQ9CQA0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpmQ9CQA0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpmQ9CQA0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpmQ9CQA0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpmQ9CQA0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms