Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ncbp2Q9CQ49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ncbp2Q9CQ49 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncbp2Q9CQ49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ncbp2Q9CQ49 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncbp2Q9CQ49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ncbp2Q9CQ49 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncbp2Q9CQ49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncbp2Q9CQ49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncbp2Q9CQ49 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncbp2Q9CQ49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp2Q9CQ49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncbp2Q9CQ49 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms