Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nsmce3Q9CPR8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nsmce3Q9CPR8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nsmce3Q9CPR8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nsmce3Q9CPR8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsmce3Q9CPR8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nsmce3Q9CPR8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nsmce3Q9CPR8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nsmce3Q9CPR8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nsmce3Q9CPR8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nsmce3Q9CPR8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nsmce3Q9CPR8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nsmce3Q9CPR8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nsmce3Q9CPR8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nsmce3Q9CPR8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nsmce3Q9CPR8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nsmce3Q9CPR8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsmce3Q9CPR8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsmce3Q9CPR8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsmce3Q9CPR8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms