Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim12aQ99PQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim12aQ99PQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim12aQ99PQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim12aQ99PQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim12aQ99PQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim12aQ99PQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim12aQ99PQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim12aQ99PQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim12aQ99PQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim12aQ99PQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim12aQ99PQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim12aQ99PQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim12aQ99PQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim12aQ99PQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim12aQ99PQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim12aQ99PQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim12aQ99PQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim12aQ99PQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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