Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn6Q99PL6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubxn6Q99PL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ubxn6Q99PL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn6Q99PL6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn6Q99PL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn6Q99PL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn6Q99PL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn6Q99PL6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn6Q99PL6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn6Q99PL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn6Q99PL6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn6Q99PL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn6Q99PL6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn6Q99PL6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn6Q99PL6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ubxn6Q99PL6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubxn6Q99PL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ubxn6Q99PL6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms