Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arl4dQ99PE9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arl4dQ99PE9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl4dQ99PE9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl4dQ99PE9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl4dQ99PE9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl4dQ99PE9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arl4dQ99PE9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arl4dQ99PE9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arl4dQ99PE9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms