Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2ird2Q99NI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2ird2Q99NI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2ird2Q99NI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2ird2Q99NI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2ird2Q99NI3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2ird2Q99NI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2ird2Q99NI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2ird2Q99NI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2ird2Q99NI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2ird2Q99NI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2ird2Q99NI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2ird2Q99NI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms