Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cadm3Q99N28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cadm3Q99N28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cadm3Q99N28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cadm3Q99N28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cadm3Q99N28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cadm3Q99N28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cadm3Q99N28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cadm3Q99N28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm3Q99N28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm3Q99N28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cadm3Q99N28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cadm3Q99N28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cadm3Q99N28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cadm3Q99N28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cadm3Q99N28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cadm3Q99N28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cadm3Q99N28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cadm3Q99N28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cadm3Q99N28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cadm3Q99N28 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms