Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brms1Q99N20 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brms1Q99N20 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brms1Q99N20 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brms1Q99N20 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brms1Q99N20 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brms1Q99N20 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brms1Q99N20 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brms1Q99N20 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brms1Q99N20 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brms1Q99N20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Brms1Q99N20 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brms1Q99N20 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brms1Q99N20 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brms1Q99N20 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brms1Q99N20 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brms1Q99N20 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brms1Q99N20 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Brms1Q99N20 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brms1Q99N20 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brms1Q99N20 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brms1Q99N20 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms