Protein–RNA interactions for Protein: Q99MZ7

Pecr, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PecrQ99MZ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PecrQ99MZ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PecrQ99MZ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PecrQ99MZ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PecrQ99MZ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PecrQ99MZ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PecrQ99MZ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PecrQ99MZ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PecrQ99MZ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PecrQ99MZ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PecrQ99MZ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PecrQ99MZ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PecrQ99MZ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms