Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaja3Q99M87 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnaja3Q99M87 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnaja3Q99M87 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnaja3Q99M87 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnaja3Q99M87 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaja3Q99M87 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaja3Q99M87 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaja3Q99M87 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dnaja3Q99M87 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaja3Q99M87 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaja3Q99M87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dnaja3Q99M87 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnaja3Q99M87 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dnaja3Q99M87 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms