Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmtm3Q99LJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmtm3Q99LJ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm3Q99LJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm3Q99LJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm3Q99LJ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm3Q99LJ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms