Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cstf3Q99LI7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cstf3Q99LI7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cstf3Q99LI7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cstf3Q99LI7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cstf3Q99LI7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cstf3Q99LI7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cstf3Q99LI7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cstf3Q99LI7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cstf3Q99LI7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cstf3Q99LI7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cstf3Q99LI7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cstf3Q99LI7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cstf3Q99LI7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cstf3Q99LI7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cstf3Q99LI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms