Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nmd3Q99L48 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nmd3Q99L48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nmd3Q99L48 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nmd3Q99L48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nmd3Q99L48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nmd3Q99L48 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nmd3Q99L48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nmd3Q99L48 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nmd3Q99L48 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nmd3Q99L48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nmd3Q99L48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nmd3Q99L48 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nmd3Q99L48 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nmd3Q99L48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nmd3Q99L48 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nmd3Q99L48 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nmd3Q99L48 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nmd3Q99L48 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nmd3Q99L48 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nmd3Q99L48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms