Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX4

Eif3m, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3mQ99JX4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3mQ99JX4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3mQ99JX4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3mQ99JX4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eif3mQ99JX4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Eif3mQ99JX4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3mQ99JX4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eif3mQ99JX4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eif3mQ99JX4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3mQ99JX4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3mQ99JX4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3mQ99JX4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3mQ99JX4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3mQ99JX4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3mQ99JX4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Eif3mQ99JX4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3mQ99JX4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Eif3mQ99JX4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Eif3mQ99JX4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms