Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk9Q99J95 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk9Q99J95 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk9Q99J95 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk9Q99J95 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk9Q99J95 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk9Q99J95 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk9Q99J95 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk9Q99J95 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk9Q99J95 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk9Q99J95 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk9Q99J95 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk9Q99J95 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk9Q99J95 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk9Q99J95 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk9Q99J95 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk9Q99J95 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk9Q99J95 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk9Q99J95 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk9Q99J95 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk9Q99J95 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk9Q99J95 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms