Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn16Q925N4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn16Q925N4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn16Q925N4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn16Q925N4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn16Q925N4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn16Q925N4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn16Q925N4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn16Q925N4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn16Q925N4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn16Q925N4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn16Q925N4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn16Q925N4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms