Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csmd1Q923L3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csmd1Q923L3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csmd1Q923L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csmd1Q923L3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csmd1Q923L3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csmd1Q923L3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csmd1Q923L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csmd1Q923L3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Csmd1Q923L3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csmd1Q923L3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csmd1Q923L3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csmd1Q923L3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csmd1Q923L3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csmd1Q923L3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csmd1Q923L3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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