Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Riok1Q922Q2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Riok1Q922Q2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Riok1Q922Q2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Riok1Q922Q2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Riok1Q922Q2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Riok1Q922Q2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Riok1Q922Q2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Riok1Q922Q2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Riok1Q922Q2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Riok1Q922Q2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Riok1Q922Q2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Riok1Q922Q2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Riok1Q922Q2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Riok1Q922Q2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Riok1Q922Q2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
Riok1Q922Q2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Riok1Q922Q2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Riok1Q922Q2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Riok1Q922Q2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Riok1Q922Q2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Riok1Q922Q2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Riok1Q922Q2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Riok1Q922Q2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Riok1Q922Q2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Riok1Q922Q2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms