Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubb6Q922F4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tubb6Q922F4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Tubb6Q922F4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tubb6Q922F4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tubb6Q922F4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tubb6Q922F4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tubb6Q922F4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tubb6Q922F4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tubb6Q922F4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tubb6Q922F4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tubb6Q922F4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tubb6Q922F4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tubb6Q922F4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tubb6Q922F4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tubb6Q922F4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tubb6Q922F4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tubb6Q922F4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tubb6Q922F4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tubb6Q922F4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tubb6Q922F4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tubb6Q922F4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tubb6Q922F4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tubb6Q922F4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tubb6Q922F4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tubb6Q922F4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tubb6Q922F4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tubb6Q922F4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tubb6Q922F4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tubb6Q922F4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tubb6Q922F4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tubb6Q922F4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tubb6Q922F4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tubb6Q922F4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tubb6Q922F4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tubb6Q922F4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tubb6Q922F4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tubb6Q922F4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms