Protein–RNA interactions for Protein: Q921U8

Smtn, Smoothelin, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmtnQ921U8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SmtnQ921U8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SmtnQ921U8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SmtnQ921U8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SmtnQ921U8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SmtnQ921U8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SmtnQ921U8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SmtnQ921U8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SmtnQ921U8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SmtnQ921U8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SmtnQ921U8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SmtnQ921U8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SmtnQ921U8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SmtnQ921U8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SmtnQ921U8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms