Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z69

Srgap1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap1Q91Z69 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Srgap1Q91Z69 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Srgap1Q91Z69 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Srgap1Q91Z69 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Srgap1Q91Z69 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Srgap1Q91Z69 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Srgap1Q91Z69 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Srgap1Q91Z69 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Srgap1Q91Z69 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Srgap1Q91Z69 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Srgap1Q91Z69 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Srgap1Q91Z69 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Srgap1Q91Z69 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Srgap1Q91Z69 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Srgap1Q91Z69 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Srgap1Q91Z69 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Srgap1Q91Z69 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Srgap1Q91Z69 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Srgap1Q91Z69 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Srgap1Q91Z69 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Srgap1Q91Z69 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,6 ms