Protein–RNA interactions for Protein: Q91WW7

Pnpla3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla3Q91WW7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnpla3Q91WW7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnpla3Q91WW7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnpla3Q91WW7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnpla3Q91WW7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnpla3Q91WW7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnpla3Q91WW7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pnpla3Q91WW7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pnpla3Q91WW7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla3Q91WW7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pnpla3Q91WW7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla3Q91WW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pnpla3Q91WW7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms