Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab3il1Q8VDV3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab3il1Q8VDV3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3il1Q8VDV3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3il1Q8VDV3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3il1Q8VDV3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3il1Q8VDV3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3il1Q8VDV3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3il1Q8VDV3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3il1Q8VDV3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3il1Q8VDV3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3il1Q8VDV3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3il1Q8VDV3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rab3il1Q8VDV3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab3il1Q8VDV3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab3il1Q8VDV3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rab3il1Q8VDV3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rab3il1Q8VDV3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab3il1Q8VDV3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3il1Q8VDV3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab3il1Q8VDV3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3il1Q8VDV3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3il1Q8VDV3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab3il1Q8VDV3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rab3il1Q8VDV3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms