Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccm2lQ8VCC6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccm2lQ8VCC6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccm2lQ8VCC6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccm2lQ8VCC6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccm2lQ8VCC6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccm2lQ8VCC6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccm2lQ8VCC6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccm2lQ8VCC6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccm2lQ8VCC6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccm2lQ8VCC6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccm2lQ8VCC6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccm2lQ8VCC6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccm2lQ8VCC6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccm2lQ8VCC6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms