Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K2

Irak4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak4Q8R4K2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irak4Q8R4K2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irak4Q8R4K2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irak4Q8R4K2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irak4Q8R4K2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irak4Q8R4K2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irak4Q8R4K2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irak4Q8R4K2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irak4Q8R4K2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irak4Q8R4K2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irak4Q8R4K2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irak4Q8R4K2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irak4Q8R4K2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Irak4Q8R4K2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irak4Q8R4K2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irak4Q8R4K2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irak4Q8R4K2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irak4Q8R4K2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irak4Q8R4K2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms