Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup58Q8R332 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup58Q8R332 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup58Q8R332 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup58Q8R332 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup58Q8R332 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup58Q8R332 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nup58Q8R332 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nup58Q8R332 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup58Q8R332 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup58Q8R332 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup58Q8R332 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup58Q8R332 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup58Q8R332 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup58Q8R332 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup58Q8R332 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup58Q8R332 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup58Q8R332 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup58Q8R332 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms