Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim29Q8R2Q0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim29Q8R2Q0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim29Q8R2Q0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim29Q8R2Q0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim29Q8R2Q0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim29Q8R2Q0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim29Q8R2Q0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim29Q8R2Q0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim29Q8R2Q0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim29Q8R2Q0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim29Q8R2Q0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim29Q8R2Q0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim29Q8R2Q0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim29Q8R2Q0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim29Q8R2Q0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim29Q8R2Q0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim29Q8R2Q0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim29Q8R2Q0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim29Q8R2Q0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim29Q8R2Q0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim29Q8R2Q0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim29Q8R2Q0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trim29Q8R2Q0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms