Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc80Q8R2G6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc80Q8R2G6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc80Q8R2G6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc80Q8R2G6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc80Q8R2G6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc80Q8R2G6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc80Q8R2G6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc80Q8R2G6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc80Q8R2G6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc80Q8R2G6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc80Q8R2G6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc80Q8R2G6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc80Q8R2G6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc80Q8R2G6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc80Q8R2G6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc80Q8R2G6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc80Q8R2G6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc80Q8R2G6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc80Q8R2G6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc80Q8R2G6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms