Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1U1

Cog4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog4Q8R1U1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cog4Q8R1U1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cog4Q8R1U1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cog4Q8R1U1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog4Q8R1U1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog4Q8R1U1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog4Q8R1U1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cog4Q8R1U1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog4Q8R1U1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog4Q8R1U1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cog4Q8R1U1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cog4Q8R1U1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cog4Q8R1U1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cog4Q8R1U1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cog4Q8R1U1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cog4Q8R1U1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog4Q8R1U1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cog4Q8R1U1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cog4Q8R1U1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cog4Q8R1U1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cog4Q8R1U1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog4Q8R1U1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms